Em um mundo onde os Mestres empunham humanos selecionados que podem se transformar em armas, o senhor Shinigami criou uma escola para ensinar jovens mestres e seus parceiros metamorfos, o que significa ser um deus da morte justo. Para criar a arma definitiva, os alunos da escola devem coletar as almas de 99 humanos malvados e 1 de bruxa.

Maka Albarn e seu parceiro “Soul” Evans, são dois estudantes que esperam fazer uma foice da morte perfeita. Eles se juntam ao barulhento Black☆Star e sua parceira Tsubaki Nakatsukasa, bem como o perfeccionista Death the Kid, e suas parceiras, as gêmeas Patricia “Patty” e Elizabeth “Liz” Thompson. Todos esses alunos ambiciosos trabalham para se tornar a melhor equipe de Mestre e Arma Demônio, através de desventuras, missões e muitas provações de classe.

No entanto, muitos mistérios os cercam e, à medida que novos inimigos são descobertos e segredos são revelados, Maka, Soul e seus amigos devem lutar para proteger a academia, e o próprio mundo de inimigos muito piores que os humanos.